Docking protéine-ligand avec le logiciel YASARA

Sessions :

Le 14 septembre 2018 à Lyon

Le 13 septembre 2019 à Lyon

// De 9h00 à 17h00

Durée : 1 journée – 7 heures

Pédagogie :

Effectif : 10 Personnes
50% de pratique
Chaque auditeur disposera d’un poste informatique individuel pendant la formation
Remise de support de cours
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

Référence : BIF-43

> Frais pédagogiques :

500 € HT

Académiques : 450 € HT

> Intervenant :

Dr. E. Bettler

> Public concerné :

Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens.

PROGRAMME

Docking protéine-ligand avec YASARA

Lors de cette formation, un bref rappel sera fait sur les principes du docking.

Docking de petites molécules à l’aide des logiciels Autodock et VINA via le logiciel YASARA.

Calcule de l’énergie de liaison et de la constante d’inhibition.

Optimisation de la conformation d’un ligand.

OBJECTIFS

• Comprendre la notion de docking
• Réaliser ses propres docking à l’aide du logiciel YASARA
• Analyser les résultats

A l’issue de cette formation, vous serez en mesure de :

• Comprendre l’intérêt du docking et dans quel contexte l’utiliser
• Utiliser les logiciels Autodock et VINA via le logiciel YASARA pour docker de petites molécules
• Calculer les énergies de liaison et de constante d’inhibition d’un ligand
• Optimiser la conformation d’un ligand