Docking protéine-ligand avec le logiciel YASARA

• Session :
  • Le 11 septembre 2020 à Lyon
  • De 9h00 à 17h00

• Durée : 1 journée – 7 heures

• Pédagogie : Effectif : 10 Personnes
  50% de pratique
  Chaque auditeur disposera d’un poste informatique individuel pendant la formation
  Remise de support de cours
  La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

• Référence : BIF-43

> Frais pédagogiques :

500 € HT

Académiques : 450 € HT

> Intervenant :

Dr. E. Bettler

> Public concerné :

Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens.

PROGRAMME

Docking protéine-ligand avec YASARA

Lors de cette formation, un bref rappel sera fait sur les principes du docking.

Docking de petites molécules à l’aide des logiciels Autodock et VINA via le logiciel YASARA.

Calcule de l’énergie de liaison et de la constante d’inhibition.

Optimisation de la conformation d’un ligand.

OBJECTIFS

• Comprendre la notion de docking
• Réaliser ses propres docking à l’aide du logiciel YASARA
• Analyser les résultats

A l’issue de cette formation, vous serez en mesure de :

• Comprendre l’intérêt du docking et dans quel contexte l’utiliser
• Utiliser les logiciels Autodock et VINA via le logiciel YASARA pour docker de petites molécules
• Calculer les énergies de liaison et de constante d’inhibition d’un ligand
• Optimiser la conformation d’un ligand