Quantification absolue des peptides et protéines : un outil multiplexé pour l'évaluation clinique des biomarqueurs et la Biologie des systèmes

• Session : En intra sur demande
• Durée : 2 journées – 14 heures

•  Pédagogie : Effectif : 12 Personnes
  Remise de support de cours
  La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.
• Référence : BCH-10

• Frais pédagogiques : sur devis
• Intervenant : Pr. J. Lemoine
• Public concerné : Personnels scientifiques et techniques voulant s’initier à l’étude des biomolécules par spectrométrie de Masse

PROGRAMME

Contexte et problématique de l’analyse protéomique des biomarqueurs en étude clinique.

Intérêt des méthodes de quantification absolue ciblée dans le cas des peptides et des protéines.

Rappels essentiels sur la spectrométrie de masse des peptides protéines (ionisation, états de charge, distribution isotopique).

Méthodes de dissociation des peptides et protéines (CID, ECD, ETD, LID) et voies de fragmentation.

Choix des peptides protéotypiques, des transitions, validation des transitions.

Problématiques spécifiques aux protéines/ peptides :
effet matrice, modifications post-traductionnelles, modifications chimiques.

Les méthodes d’étalonnage

externe, AQUA, Qconcat, PSAQ…

Préparation des échantillons

immuno déplétion, immuno purification, chromatographie multi dimensionnelle, extraction en phase solide

Analyse et commentaire des références bibliographiques majeures.

OBJECTIFS