Analyse des données de cytométrie : utilisation du logiciel FlowJo 10 (TreeStar Inc.) – Win10

• Session :
• 17 &18 septembre 2018 à Lyon
• // De 9h00 à 17h00

• Durée : 2 journées – 14 heures
• Pédagogie : Effectif : 8 Personnes
  Remise de support de cours
  La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.
• Référence : BMC-03

• Frais pédagogiques : 1000 € HT / Académiques : 800 € HT
  
• Public concerné : Chercheurs, ingénieurs et techniciens; Des connaissances de base en  cytométrie sont requises

Programme

Présentation générale du logiciel FlowJo et des différentes fonctions.

Vue d’ensemble sur l’analyse des données :

Feuilles de travail.

Affichage des données.

Préférences du logiciel : réglages généraux.

Fenêtrage et statistiques.

Création de groupes.

Les Erreurs de visualisation et édition de la fonction bi-exponentielle

Présentation des données : Graphiques, overlays

Analyse en batch et système d’itération

Table statistique : Création et analyse en Batch

Système d’exportation des données et des graphiques

Les Compensations

Contrôle des compensations.

Edition de la matrice de compensation des échantillons.

Création d’une matrice de compensation automatique, utilisation de l’assistant.

Réglages des préférences du logiciel

Modules spécifiques d’analyse de données et préférences spécifiques

Prolifération.

Cycle et module de comparaison des populations.

Flux calcique & création de paramètres dérivés.

Travaux Tutorés

A-MANIPULATION D’UN FICHIER DE DONNEES MULTIPARAMETRIQUE 8 COULEURS

Définition des préférences de déploiement de la fonction Bi-Exponentielle.

Affichage systématique des dots plots bi-paramétriques.

Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle.

Edition de la matrice de compensation.

Création d’une hiérarchie.

Création d’un paramètre dérivé (ex. Fs/FL1 -> export / concaténation.).

Utilisation des « gates » combinées et d’une « not-gate ».

Insertion de statistiques.

Création d’un rapport d’analyse + « multigraphe overlay » sur gates combinées.

Création d’une table statistique.

Sauvegarde « As ».

Sauvegarde comme matrice et test de la matrice.

B- CREATION D’UNE MATRICE DE COMPENSATION A L’AIDE DE L’ASSISTANT (DATA « BIOMATH »)

C- ANALYSE DE DIFFERENTS FICHIERS DE DONNEES (TEMPS ET PANELS)

Création de groupes par mots clefs et panels.

Affichage systématique.

Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle.

Création d’une hiérarchie & édition de la barre de « workspace ».

Feuille d’analyse.

Batch par groupe.

« Mutigraphe overlays » & Batch.

« Overlay » avec maintiens d’un tube contrôle.

Feuille de statistiques & Création d’une fonction statistique.

TRAVAUX DIRIGES ANALYSE DE FICHIERS 

Equipement

Logiciel d’analyse FlowJo

OBJECTIFS

• Utiliser Flow Jo et ses fonctions de base : présentation des données : graphiques, overlays, analyse en batch et système d’itération, table statistique, création et analyse en Batch, système d’exportation des données et des graphiques, les compensations
• Manipuler et savoir analyser des fichiers de données multiparamétriques