Analyse des données de cytométrie : utilisation du logiciel FlowJo 10 (TreeStar Inc.) – Win10

• Session :
  • En intra, sur demande

// De 9h00 à 17h00

• Durée : 2 journées – 14 heures
• Pédagogie : Effectif : 8 Personnes

Formation théorique et pratique – Travaux tutorés
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

• Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut débit // Un support de cours couleur // Un paperboard

• Référence : BMC-03

• Frais pédagogiques :

Sur devis

• Formateur :

M. A. Corneau

• Public concerné :

Chercheurs, ingénieurs et techniciens

• Prérequis :

Connaissances de base en cytométrie

 

Programme

Présentation générale du logiciel FlowJo et des différentes fonctions.

Vue d’ensemble sur l’analyse des données :

> Feuilles de travail

> Affichage des données

> Préférences du logiciel : réglages généraux

> Fenêtrage et statistiques

> Création de groupes

Les Erreurs de visualisation et édition de la fonction bi-exponentielle

Présentation des données : Graphiques, overlays

Analyse en batch et système d’itération

Table statistique : Création et analyse en Batch

Système d’exportation des données et des graphiques

Les Compensations

> Contrôle des compensations

> Edition de la matrice de compensation des échantillons

> Création d’une matrice de compensation automatique, utilisation de l’assistant

Réglages des préférences du logiciel

Modules spécifiques d’analyse de données et préférences spécifiques

 > Prolifération

 > Cycle et module de comparaison des populations

 > Flux calcique & création de paramètres dérivés

Travaux Tutorés

MANIPULATION D’UN FICHIER DE DONNEES MULTIPARAMETRIQUE 8 COULEURS

 > Définition des préférences de déploiement de la fonction Bi-Exponentielle

 > Affichage systématique des dots plots bi-paramétriques

 > Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle

 > Edition de la matrice de compensation

 > Création d’une hiérarchie

 > Création d’un paramètre dérivé (ex. Fs/FL1 -> export / concaténation.)

 > Utilisation des « gates » combinées et d’une « not-gate »

 > Insertion de statistiques

 > Création d’un rapport d’analyse + « multigraphe overlay » sur gates combinées

 > Création d’une table statistique

 > Sauvegarde « As »

 > Sauvegarde comme matrice et test de la matrice

CREATION D’UNE MATRICE DE COMPENSATION A L’AIDE DE L’ASSISTANT (DATA « BIOMATH »)

ANALYSE DE DIFFERENTS FICHIERS DE DONNEES (TEMPS ET PANELS)

 > Création de groupes par mots clefs et panels

 > Affichage systématique

 > Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle

 > Création d’une hiérarchie & édition de la barre de « workspace »

 > Feuille d’analyse

 > Batch par groupe

 > « Mutigraphe overlays » & Batch

 > « Overlay » avec maintiens d’un tube contrôle

 > Feuille de statistiques & Création d’une fonction statistique

TRAVAUX DIRIGES ANALYSE DE FICHIERS 

Equipement

Logiciel d’analyse FlowJo

OBJECTIFS

• Utiliser Flow Jo et ses fonctions de base : présentation des données : graphiques, overlays, analyse en batch et système d’itération, table statistique, création et analyse en Batch, système d’exportation des données et des graphiques, les compensations
• Manipuler et savoir analyser des fichiers de données multiparamétriques