Théorique & Pratiques
Analyse des données de cytométrie : utilisation du logiciel FlowJo 10 (TreeStar Inc.) – Win10
S'inscrire- Session :
- En intra, sur demande
// De 9h00 à 17h00
- Durée : 2 journées – 14 heures
- Pédagogie : Effectif : 8 Personnes
Formation théorique et pratique – Travaux tutorés
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.
- Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut débit // Un support de cours couleur // Un paperboard
- Référence : BMC-03
- Frais pédagogiques :
Sur devis
- Formateur :
M. A. Corneau
- Public concerné :
Chercheurs, ingénieurs et techniciens
- Prérequis :
Connaissances de base en cytométrie
Programme
Présentation générale du logiciel FlowJo et des différentes fonctions.
Vue d’ensemble sur l’analyse des données :
> Feuilles de travail
> Affichage des données
> Préférences du logiciel : réglages généraux
> Fenêtrage et statistiques
> Création de groupes
Les Erreurs de visualisation et édition de la fonction bi-exponentielle
Présentation des données : Graphiques, overlays
Analyse en batch et système d’itération
Table statistique : Création et analyse en Batch
Système d’exportation des données et des graphiques
Les Compensations
> Contrôle des compensations
> Edition de la matrice de compensation des échantillons
> Création d’une matrice de compensation automatique, utilisation de l’assistant
Réglages des préférences du logiciel
Modules spécifiques d’analyse de données et préférences spécifiques
> Prolifération
> Cycle et module de comparaison des populations
> Flux calcique & création de paramètres dérivés
Travaux Tutorés
MANIPULATION D’UN FICHIER DE DONNEES MULTIPARAMETRIQUE 8 COULEURS
> Définition des préférences de déploiement de la fonction Bi-Exponentielle
> Affichage systématique des dots plots bi-paramétriques
> Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle
> Edition de la matrice de compensation
> Création d’une hiérarchie
> Création d’un paramètre dérivé (ex. Fs/FL1 -> export / concaténation.)
> Utilisation des « gates » combinées et d’une « not-gate »
> Insertion de statistiques
> Création d’un rapport d’analyse + « multigraphe overlay » sur gates combinées
> Création d’une table statistique
> Sauvegarde « As »
> Sauvegarde comme matrice et test de la matrice
CREATION D’UNE MATRICE DE COMPENSATION A L’AIDE DE L’ASSISTANT (DATA « BIOMATH »)
ANALYSE DE DIFFERENTS FICHIERS DE DONNEES (TEMPS ET PANELS)
> Création de groupes par mots clefs et panels
> Affichage systématique
> Edition et ajustement de la fonction Bi-Exponentielle
> Création d’une hiérarchie & édition de la barre de « workspace »
> Feuille d’analyse
> Batch par groupe
> « Mutigraphe overlays » & Batch
> « Overlay » avec maintiens d’un tube contrôle
> Feuille de statistiques & Création d’une fonction statistique
TRAVAUX DIRIGES ANALYSE DE FICHIERS
Equipement
Logiciel d’analyse FlowJo
OBJECTIFS
- Utiliser Flow Jo et ses fonctions de base : présentation des données : graphiques, overlays, analyse en batch et système d’itération, table statistique, création et analyse en Batch, système d’exportation des données et des graphiques, les compensations
- Manipuler et savoir analyser des fichiers de données multiparamétriques
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Dernière modification le 22 janvier 2021 à 12:36