Formation théorique & Pratique

Microdissection laser et Microgénomique : analyse génomique à l’échelle tissulaire ou cellulaire

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> Sessions :

  • En intra, sur demande.

> Durée :

3 journées – 21h

> Pédagogie :

Effectif : 6 Personnes

Remise de support de cours
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

> Référence : BMC-

  • Frais pédagogiques : Sur demande
  • Intervenants : Mme C. Bevilacqua & M. B. Ducos
  • Public concerné : Techniciens et chercheurs souhaitant se former à la microdissection laser et microgénomique

PROGRAMME

1ÈRE  JOURNÉE :  préparation de coupes histologiques (microdissection).

Bases théoriques  LM :

    • prélèvements et conservation du tissu
    • Cryocoupes ou FFPE
    • coloration et déshydratation des coupes
    • microdissection laser

TP : LM

2ÈME JOURNÉE  : extraction et contrôle qualité des biomolécules et synthèse cDNA.

Bases théoriques :

    • extraction d’ARN ou ADN
    • contrôle qualité (RIN) et mesure quantité : spectrophotométrie, fluorimétrie et électrophorèse capillaire

TP : extraction et QC

Bases théoriques : retrotranscription

TP :  préparation des cDNA

 

3ÈME JOURNÉE  : analyses microgénomiques : qPCR, dPCR, NGS, microarray, protéomique

Bases théoriques :

    • Méthodes d’amplification des acides nucléiques
    • quelle méthode d’analyse choisir en fonction de la question posée : avantage et limites des différentes technologies
    • Pièges à éviter pour obtenir des résultats fiables en microgénomique
    • Base théoriques de la qPCR (bas et haut débit)

TP : qPCR et/ou dPCR

 

OBJECTIFS

  • Rendre autonome l’utilisateur dans toutes les étapes critiques de la préparation des coupes histologiques destinées à la microdissection
  • Permettre à l’utilisateur d’obtenir des biomolécules de qualité à partir du matériel microdissequé
  • Permettre à l’utilisateur de connaitre les différentes méthodes d’analyse possibles à partir de cellules microdissequées

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