Microdissection laser et Microgénomique : analyse génomique à l’échelle tissulaire ou cellulaire

• Session :

En intra sur demande

• Durée :

3 journées – 21 heures

• Pédagogie : Effectif : 6 Personnes

Travaux pratiques
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.

• Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement :

Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut-débit // Un support de cours couleur // Un paperboard

• Référence : BMC-44

• Frais pédagogiques :

Sur devis

• Formateurs :

Mme C. Bevilacqua & M. B. Ducos

• Public concerné :

Personnels scientifiques, techniques, chercheurs, ingénieurs, techniciens, médecins, biologistes.

• Prérequis :

Aucun

PROGRAMME

1ÈRE  JOURNÉE :  Préparation de coupes histologiques (microdissection).

Bases théoriques  LM :
Prélèvements et conservation du tissu
Cryocoupes ou FFPE
Coloration et déshydratation des coupes
Microdissection laser
TP : LM

2ÈME JOURNÉE  : Extraction et contrôle qualité des biomolécules et synthèse cDNA.

Bases théoriques :
extraction d’ARN ou ADN
contrôle qualité (RIN) et mesure quantité : spectrophotométrie, fluorimétrie et électrophorèse capillaire
TP : extraction et QC

Bases théoriques : retrotranscription
TP :  préparation des cDNA

3ÈME JOURNÉE  : Analyses microgénomiques : qPCR, dPCR, NGS, microarray, protéomique

Bases théoriques :
Méthodes d’amplification des acides nucléiques
quelle méthode d’analyse choisir en fonction de la question posée : avantage et limites des différentes technologies
Pièges à éviter pour obtenir des résultats fiables en microgénomique
Base théoriques de la qPCR (bas et haut débit)
TP : qPCR et/ou dPCR

OBJECTIFS

• Etre autonome dans toutes les étapes critiques de la préparation des coupes histologiques destinées à la microdissection
• Oobtenir des biomolécules de qualité à partir du matériel microdissequé
• Connaitre les différentes méthodes d’analyse possibles à partir de cellules microdissequées