Formation théorique

Génomique de la cellule unique

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> Sessions :

Le 17 décembre 2018 à Lyon

Le 9 septembre 2019 à Lyon

// De 9h à 17h

> Durée : 1 journée – 7 heures

> Pédagogie : Effectif : 14 Personnes

Référence : BMC-25

> Frais pédagogiques

500 € HT

Académiques : 450 € HT

> Intervenant : M. J. Lachuer

> Public concerné :

Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, étudiants) souhaitant s’initier aux technologies de séquençage à l’échelle de la cellule unique : single cell.


PROGRAMME

Les méthodes de dissociation des tissus

Les méthodes de fixation des tissus avant dissociation

Les technologies d’isolement cellulaire (microfluidique, nano gouttelettes, capture laser, filtre,  cages électriques…)

Les méthodes d’amplification de l’ARN/ADN sur cellule unique (à partir du lysat cellulaire)

Les technologies d’analyse (PCR/NGS fragments courts et fragments longs)

Application à l’étude du transcriptome (expression différentielle, analyse de variants, ARN fusion)

Application à l’analyse du génome (whole genome sequencing, whole exome, ATAC-seq…)

Application à l’étude du méthylome par Reduced Representation Bisulfite Sequencing (RRBS)

Analyse multi-omique sur cellule unique

Les méthodes d’analyse bioinformatique (introduction)

Discussion sur les projets des auditeurs 

 

OBJECTIFS

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