Formation théorique
Principes et applications des nouvelles méthodes de séquençage à haut-débit (NGS) : choisir la technologie adaptée à son projet
s'inscrire- Sessions :
- Les 28 et 29 novembre 2022 à Paris
- Les 11 et 12 mai 2023 à Paris
// J1 : 13h30-17h et J2 : 9h-17h
- Durée :
1,5 journées – 10,5 heures
- Pédagogie : Effectif : 12 Personnes
Mise en situation et exercices pratiques
La formation sera sanctionnée par une attestation de formation.
- Moyens pédagogiques et techniques d’encadrement
Un vidéoprojecteur // Connexion WIFI haut débit // Un support de cours numérique // Un paperboard
- Accessibilité :
Formation accessible au public à mobilité réduite – Adaptation des moyens de la prestation aux personnes en situation de handicap
- Référence : BMC-18
- Frais pédagogiques :
2022 : 800 € HT / Académiques : 700 € HT
2023 : 900 € HT / Académiques : 830 € HT
Déjeuner offert
- Formateurs :
Mme S. Hughes & M. B. Gillet
- Public concerné :
Biologistes (Chercheurs, ingénieurs, assistant ingénieurs, techniciens, étudiants), Médecin, Pharmacien ayant un projet NGS et souhaitant faire le point sur l’ensemble des technologies disponibles et des avantages/inconvénients de chacune en fonction des projets.
- Prérequis :
Compétence de base en Biologie Moléculaire – Niveau L2
PROGRAMME
A. Les méthodes de séquençages : principes
Présentation des différentes méthodes de séquençage à haut-débit
Principe et fonctionnement
Capacité de séquençage
Comparatif des différences méthodes, forces et faiblesses
Les technologies de demain
B. De l’échantillon à la séquence : les grandes étapes méthodologiques
1. Préparation des échantillons
1.1. Les différentes étapes clés méthodologiques
1.2. Garantir la qualité des données de séquençage
1.3. Penser son expérimentation
1.4. La production des échantillons biologiques
1.5. Extraction et purification des acides nucléiques
2. Captures et enrichissement
2.1. Capture d’hybrides
2.2. Amplification PCR
2.3. Immunoprécipitation
3. Autres approches méthodologiques
4. Construction des différents types de banques
4.1. Les étapes clés
4.2. Construction des banques à ADN
4.3. Construction des banques à partir d’ARN
4.4. Veille et innovation technologique
5. Préparation de banques et séquençage sur plateforme Ion Torrent PGM : exemple
C. L’analyse des données de séquençage
Introduction
La production des données
L’analyse
Les bases de données
Conclusions
D. Les différentes applications NGS : quelle méthode choisir en fonction de mon application ?
Introduction
La génomique structurale
La génomique fonctionnelle
Métagénomique et environnement
Conclusions
E. Bilan et questions
OBJECTIFS/COMPETENCES
Différencier les techniques de séquençage à haut-débit: distinguer et comparer les différentes technologies NGS
Acquérir les principes de fonctionnement des différentes technologies NGS pour critiquer, différencier, identifier, et choisir la meilleure technologie en fonction du besoin
Connaitre les différentes applications possibles des méthodes NGS et leurs spécificités.
Définir, justifier et recommander une technologie NGS en fonction de l’application souhaitée
Différencier les grandes étapes méthodologiques, avant et après séquençage, pour mettre en oeuvre son projet de séquençage
Améliorer, concevoir et appliquer de nouveaux protocoles adaptés à ses projets
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Dernière modification le 21 juillet 2022 à 11:00